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Bioinformatik der Infektionsforschung

Bakterielle und virale Krankheitserreger

BRICS

Die Abteilung entwickelt computergestützte Verfahren, um aus großen biologischen und epidemiologischen Datensätzen verwertbare Erkenntnisse für die Infektionsforschung zu gewinnen. Unsere Arbeiten umfassen die Entwicklung, Validierung und Anwendung neuer computergestützter Methoden. Wir kombinieren Methoden des maschinellen Lernens, der statistischen Modellierung, der vergleichenden Genomik und der Metagenomik, um das menschliche Mikrobiom sowie bakterielle und virale Krankheitserreger zu analysieren. Damit tragen wir zur Erforschung antimikrobieller Resistenzen und neuartiger Antiinfektiva, zur Präzisions-Infektionsmedizin sowie zur Pandemie-Resilienz bei.

Leitung

Prof. Dr. Alice McHardy

Forschungsgruppenleiterin

+49 531 391-55271 E-Mail

Unsere Forschung

Die Abteilung „Bioinformatik der Infektionsforschung“ erforscht das menschliche Mikrobiom sowie virale und bakterielle Krankheitserreger einzelner Patientinnen und Patienten durch die Analyse großer biologischer und epidemiologischer Datensätze mithilfe rechnergestützter Verfahren. Mit Schwerpunkt auf Meta-Omics- und populationsgenomischen Daten entwickeln wir Hypothesen zu Genen oder genetischen Veränderungen, die für das Entstehen einer Erkrankung, eine effektive Immunantwort oder die Entwicklung von Antibiotikaresistenzen relevant sind. Wir arbeiten mit experimentellen Partnern zusammen, um diese Vorhersagen zu überprüfen und deren Translation in die medizinische Therapie oder Diagnostik zu fördern. Um unsere Forschungsziele zu erreichen, entwickeln wir außerdem neue Algorithmen und Software.