Datengesteuerte klinische Mikrobiologie
Unsere Forschung
Die Nachwuchsforschungsgruppe „Datengesteuerte klinische Mikrobiologie“ arbeitet daran, den Verlauf von Infektionen krankenhausassoziierter bakterieller Erreger besser zu verstehen. Wir nutzen Daten, die während Krankenhausaufenthalten gesammelt werden, einschließlich berichteter oder neu diagnostizierter Vorerkrankungen, spezifischer Laborwerte sowie Informationen zur Notwendigkeit und Dauer eines Intensivaufenthalts. Darüber hinaus erzeugt die Routinediagnostik von bakteriellen Infektionen umfangreiche Daten, wie z.B. Wachstumseigenschaften der Erreger oder Resistenzen gegenüber antimikrobiellen Wirkstoffen (Antibiogramme). Durch die enge Zusammenarbeit mit dem Institut für Medizinische Mikrobiologie und Krankenhaushygiene der MHH, können diese Daten genutzt werden, um Prognosen oder Risikobewertungen für bestimmte Erreger abzuleiten.
Um die untersuchten Bakterien anhand ihres Verwandtschaftsgrades zu klassifizieren oder die Funktion bestimmter Gene aufzuklären, wird das gesamte bakterielle Genom mittels Sequenzierungsverfahren untersucht und somit eine genaue Charakterisierung ermöglicht. Auch hieraus ergeben sich große Datenmengen, die genutzt werden, um bakterielle Erreger im Kontext des Krankenhauses besser zu verstehen. Die Zusammenführung von klinischen und diagnostischen Daten mit den genetischen Informationen erlaubt es, Antworten auf folgende Fragen zu finden: Was ermöglicht Bakterien, Infektionen hervorzurufen? Wie werden sie innerhalb des Krankenhauses übertragen? Welche Eigenschaften weisen multiresistente Bakterien auf? Welche Erkenntnisse können aus der Ganzgenomsequenzierung für die Behandlung dieser Erreger gewonnen werden?
Die Hypothesen für Forschungsprojekte basieren auf der klinisch-diagnostischen Tätigkeit von Dr. Knegendorf, die ebenfalls Beratungen zur antimikrobiellen Therapie umfasst, und sind dabei an den konkreten Bedarfen einer zeitgemäßen Diagnostik und Therapie von Patientinnen und Patienten orientiert.
Unsere Forschung
Die Nachwuchsforschungsgruppe „Datengesteuerte klinische Mikrobiologie“ arbeitet daran, den Verlauf von Infektionen krankenhausassoziierter bakterieller Erreger besser zu verstehen. Wir nutzen Daten, die während Krankenhausaufenthalten gesammelt werden, einschließlich berichteter oder neu diagnostizierter Vorerkrankungen, spezifischer Laborwerte sowie Informationen zur Notwendigkeit und Dauer eines Intensivaufenthalts. Darüber hinaus erzeugt die Routinediagnostik von bakteriellen Infektionen umfangreiche Daten, wie z.B. Wachstumseigenschaften der Erreger oder Resistenzen gegenüber antimikrobiellen Wirkstoffen (Antibiogramme). Durch die enge Zusammenarbeit mit dem Institut für Medizinische Mikrobiologie und Krankenhaushygiene der MHH, können diese Daten genutzt werden, um Prognosen oder Risikobewertungen für bestimmte Erreger abzuleiten.
Um die untersuchten Bakterien anhand ihres Verwandtschaftsgrades zu klassifizieren oder die Funktion bestimmter Gene aufzuklären, wird das gesamte bakterielle Genom mittels Sequenzierungsverfahren untersucht und somit eine genaue Charakterisierung ermöglicht. Auch hieraus ergeben sich große Datenmengen, die genutzt werden, um bakterielle Erreger im Kontext des Krankenhauses besser zu verstehen. Die Zusammenführung von klinischen und diagnostischen Daten mit den genetischen Informationen erlaubt es, Antworten auf folgende Fragen zu finden: Was ermöglicht Bakterien, Infektionen hervorzurufen? Wie werden sie innerhalb des Krankenhauses übertragen? Welche Eigenschaften weisen multiresistente Bakterien auf? Welche Erkenntnisse können aus der Ganzgenomsequenzierung für die Behandlung dieser Erreger gewonnen werden?
Die Hypothesen für Forschungsprojekte basieren auf der klinisch-diagnostischen Tätigkeit von Dr. Knegendorf, die ebenfalls Beratungen zur antimikrobiellen Therapie umfasst, und sind dabei an den konkreten Bedarfen einer zeitgemäßen Diagnostik und Therapie von Patientinnen und Patienten orientiert.
Dr. med. Leonard Knegendorf
In der Infektionsdiagnostik entstehen zunehmend vielfältige Möglichkeiten zur Datenintegration, die wir gezielt für Patient:innen nutzbar machen wollen.
Dr. med. Leonard Knegendorf (geb. 1994) ist seit 2024 Juniorgruppenleiter am TWINCORE und Facharzt für Mikrobiologie, Virologie und Infektionsepidemiologie. Er arbeitet klinisch am Institut für Medizinische Mikrobiologie und Krankenhaushygiene der Medizinischen Hochschule Hannover und bewegt sich an der Schnittstelle von Patientenversorgung und datengetriebener Infektionsforschung.
Er studierte Humanmedizin in Hannover (Approbation 2020) und promovierte parallel am TWINCORE in der Arbeitsgruppe von Prof. Eike Steinmann zur molekularen Charakterisierung der Replikation des Hepatitis-E-Virus und genotypspezifischer Unterschiede. Ergänzend absolvierte er 2023 einen Master in Biomedizinischer Informatik und Data Science. Seine Arbeit fokussiert auf die datengetriebene Analyse bakterieller Infektionen. Seine Publikationen befassen sich mit epidemiologischen Risikofaktoren und genomischen Analysen krankenhausassoziierter Erreger, darunter Sequenzierungsstudien in definierten Patientenkollektiven wie Blutstrominfektionen und Intensivmedizin, mit einer zunehmenden Ausrichtung auf die Integration großer klinischer und genomischer Datensätze im Sinne datengetriebener, nicht-vordefinierter Analysen.
Ausgewählte Publikationen
Böhne, C., Baier, C., Erdmann, J., Ebadi, E., Zirkler, C., Lindenberg, M., Schlüter, D., Pirr, S., Peter, C., Bohnhorst, B., & Knegendorf, L. (2026). Prospective genomic and epidemiologic surveillance of Klebsiella pneumoniae in a tertiary NICU. Antimicrobial resistance and infection control, 15(1), 64. https://doi.org/10.1186/s13756-026-01753-4
Knegendorf, L., Sommer, A., Baier, C., Weber, R. E., Fischer, M. A., Werner, G., Ziesing, S., & Schlüter, D. (2026). Genomic epidemiology of Enterococcus faecium bloodstream infections during a VanB-type VRE peak reveals an oligoclonal scenario: an observational study at a German university hospital (2017-2022). Journal of clinical microbiology, 64(4), e0104425. https://doi.org/10.1128/jcm.01044-25
Rubalskii, E., Sedlacek, L., Hegermann, J., Knegendorf, L., Salmoukas, C., Mueller, C., Schwerk, N., Schlüter, D., Ruhparwar, A., Kuehn, C., & Ruemke, S. (2025). Characterization and genome analysis of the novel virulent Burkholderia phage Bm1, which is active against pan-drug-resistant Burkholderia multivorans. Archives of virology, 170(5), 106. https://doi.org/10.1007/s00705-025-06282-w
Vital, M., Woltemate, S., Schlüter, D., Krezdorn, N., Dieck, T., Dastagir, K., Bange, F. C., Ebadi, E., Vogt, P. M., Knegendorf, L., & Baier, C. (2024). Molecular epidemiology, microbiological features and infection control strategies for carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii in a German burn and plastic surgery center (2020-2022). Antimicrobial resistance and infection control, 13(1), 99. https://doi.org/10.1186/s13756-024-01459-5
Böhne, C., Knegendorf, L., Schwab, F., Ebadi, E., Bange, F. C., Vital, M., Schlüter, D., Hansen, G., Pirr, S., Peter, C., Bohnhorst, B., & Baier, C. (2022). Epidemiology and infection control of Methicillin-resistant Staphylococcus aureus in a German tertiary neonatal intensive and intermediate care unit: A retrospective study (2013-2020). PloS one, 17(9), e0275087. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0275087
Publikationen
Eine vollständige Liste der Publikationen finden Sie hier.
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