Unsere Forschung
Die Abteilung für Klinische Bioinformatik befasst sich mit computergestützten Methoden zur Analyse von Nukleinsäuren, hauptsächlich RNAs. Ein Fokus der Forschung liegt auf den regulatorischen Mechanismen nicht-kodierender RNAs und der Auswirkung verschiedener Einflussfaktoren auf das räumlich und zeitlich aufgelöste Einzelzell-Transkriptom. Ausgehend von der Erfahrung im Modellieren regulatorischer Einflüsse wird auch die Interaktion zwischen Bakterien und Menschen untersucht. Hierbei wird der Austausch von Information und Material zwischen kommensalen und pathogenen Bakterien sowie deren Wirt betrachtet. Ziel ist es, neue Naturstoffproduzenten sowie Naturstoffe zu finden, welche als Grundlage für die Entwicklung neuer Wirkstoffe dienen können. Der medizinische Schwerpunkt ist es, Alterungsprozesse und neurodegenerative Erkrankungen des Alterns wie Alzheimer und Parkinson besser zu verstehen und zu beeinflussen.
Unsere Forschung
Die Abteilung für Klinische Bioinformatik befasst sich mit computergestützten Methoden zur Analyse von Nukleinsäuren, hauptsächlich RNAs. Ein Fokus der Forschung liegt auf den regulatorischen Mechanismen nicht-kodierender RNAs und der Auswirkung verschiedener Einflussfaktoren auf das räumlich und zeitlich aufgelöste Einzelzell-Transkriptom. Ausgehend von der Erfahrung im Modellieren regulatorischer Einflüsse wird auch die Interaktion zwischen Bakterien und Menschen untersucht. Hierbei wird der Austausch von Information und Material zwischen kommensalen und pathogenen Bakterien sowie deren Wirt betrachtet. Ziel ist es, neue Naturstoffproduzenten sowie Naturstoffe zu finden, welche als Grundlage für die Entwicklung neuer Wirkstoffe dienen können. Der medizinische Schwerpunkt ist es, Alterungsprozesse und neurodegenerative Erkrankungen des Alterns wie Alzheimer und Parkinson besser zu verstehen und zu beeinflussen.
Prof. Andreas Keller
Die Bioinformatik und der Einsatz von Computern und künstlicher Intelligenz sind schon heute aus der Medikamententwicklung nicht mehr wegzudenken. Sie sind eine Grundlage für neue Erkenntnisse und innovative Lösungen, die die nächste Generation an Medikamenten ermöglicht.
Andreas Keller studierte von 2002 bis 2006 Bioinformatik in Saarbrücken und promovierte anschließend bis 2009, ebenfalls in der Bioinformatik. Anschließend wechselte Keller in die Industrie und war unter anderem bis 2013 für Siemens Healthineers tätig. In Erlangen leitete er die Gruppe für Dignostic Innovations und habilitierte parallel in der Humangenetik des Uniklinikums Saarland. Seit 2013 ist Keller Professor für Klinische Bioinformatik an der Universität des Saarlandes und seit 2018 am HIPS assoziiert. Von 2019 bis 2021 war er Gastprofessor an der Stanford University in Kalifornien. Seit 2022 leitet er neben seiner Professur an der Universität auch die Abteilung Klinische Bioinformatik am HIPS.
Keller befasst sich in seiner Forschung mit Computer-gestützten Methoden zur Analyse von RNAs. Ein Fokus der Forschung liegt auf den regulatorischen Mechanismen nicht-kodierender RNAs und der Auswirkung verschiedener Einflussfaktoren auf das zeitlich und örtlich aufgelöste Einzelzell-Transkriptom. Ausgehend von der Erfahrung im Modellieren regulatorischer Einflüsse widmet sich Keller in seiner Abteilung am HIPS der Erforschung der Interaktion von Bakterien mit Menschen. Hierbei erforscht er den Austausch von Information und Material zwischen kommensalen und pathogenen Bakterien sowie deren Wirt. Ziel ist es, neue Naturstoffproduzenten und neue Naturstoffe zu finden, welche als Grundlage für die Entwicklung neuer Wirkstoffe dienen können. Der medizinische Schwerpunkt seiner Arbeit ist es, Alterungsprozesse und neurodegenerative Erkrankungen des Alters wie Alzheimer und Parkinson besser zu verstehen und zu beeinflussen.
Ausgewählte Publikationen
Wagner V, Kern F, Hahn O, Schaum N, Ludwig N, Fehlmann T, Engel A … und Meese E, Quake S, Wyss-Coray T, Keller A. Characterizing expression changes in noncoding RNAs during aging and heterochronic parabiosis across mouse tissues. Nat Biotechnol. 2023 Apr 27. doi: 10.1038/s41587-023-01751-6
Iram T, Kern F, Kaur A, Myneni S, Morningstar AR, Shin H, Garcia MA, Yerra L, Palovics R, Yang AC … und Keller A, Zuchero JB, Wyss-Coray T. Young CSF restores oligodendrogenesis and memory in aged mice via Fgf17. Nature. 2022;605(7910):509-15. doi: 10.1038/s41586-022-04722-0
Palovics R, Keller A, Schaum N, Tan W, Fehlmann T, Borja M, Kern F, Bonanno L, Calcuttawala K, Webber J, McGeever A, Tabula Muris C … und Quake SR, Wyss-Coray T. Molecular hallmarks of heterochronic parabiosis at single-cell resolution. Nature. 2022;603(7900):309-14. doi: 10.1038/s41586-022-04461-2
Yang AC, Vest RT, Kern F, Lee DP, Agam M, Maat CA, Losada PM, Chen MB, Schaum N, Khoury N … und Keller A, Wyss-Coray T. A human brain vascular atlas reveals diverse mediators of Alzheimer's risk. Nature. 2022;603(7903):885-92. doi: 10.1038/s41586-021-04369-3
Yang AC, Kern F, Losada PM, Agam MR, Maat CA, Schmartz GP, Fehlmann T, Stein JA … und Ludwig N, Schulz-Schaeffer WJ, Keller A, Wyss-Coray T. Dysregulation of brain and choroid plexus cell types in severe COVID-19. Nature. 2021;595(7868):565-71. doi: 10.1038/s41586-021-03710-0
