Prof. Dr. Sébastien Calvignac-Spencer

Prof. Dr. Sébastien Calvignac-Spencer
Forschungsgruppenleiter

Sébastien Calvignac-Spencer studierte Biologie an der Universität Toulouse und der Universität Lyon, wo er 2007 promoviert wurde. Er kam 2010 als stellvertretender Leiter in die Gruppe von Fabian Leendertz ans RKI. Dort leitete er die Arbeitsgruppe zum Thema virale Evolution. Seit 2023 ist er Leiter der Abteilung Evolution von Krankheitserregern des Helmholtz-Instituts für One Health und Professor für Evolution von Krankheitserregern an der Universität Greifswald.

In seiner Forschung nutzt er die evolutionäre Genetik, um die komplexen Ursprünge von menschlichen und tierischen Krankheitserregern über große Zeiträume hinweg zu untersuchen - von aufkommenden Atemwegsviren des letzten Jahrhunderts wie dem Influenzavirus von 1918 bis hin zu langjährigen Begleitern der menschlichen Abstammung wie Herpes-Simplex-Viren. Er hat auch ein starkes Interesse daran, technische Grenzen auszuloten und neue Instrumente zu entwickeln. Mit seiner Arbeit leistete er Pionierarbeit bei der Verwendung wirbelloser Tiere als DNA-Probenehmer und weckte in jüngster Zeit das Interesse an alten, in Formalin fixierten Proben - sein Labor hat das bisher älteste Genom eines RNA-Virus, das den Menschen infiziert, aus einem Masernfall von 1912 gewonnen.

Sébastien Calvignac-Spencer ist Mitherausgeber mehrerer Fachzeitschriften (Virus Genes, Evolution, Medicine and Public Health, Molecular Ecology und Molecular Ecology Resources) und derzeit Vorsitzender der Polyomaviridae Studiengruppe des International Committee on Taxonomy of Viruses.

Publikationen

Gogarten J.F., Düx A., Gräßle T., Lumbu C.P., Markert S., Patrono L.V., Pleh K.A., Singa F.N., Tanga C.T.F., Tombolomako T.B., Couacy-Hymann E., Kouadio L., Ahuka-Mundeke S., Makouloutou-Nzassi P., ... , Calvignac-Spencer S., Leendertz F.H. (2024)
An ounce of prevention is better: Monitoring wildlife health as a tool for pandemic prevention
EMBO Rep.

Hämmerle M., Rymbekova A., Gelabert P., Sawyer S., Cheronet O., Bernardi P., Calvignac-Spencer S., Kuhlwilm M., ... , Guellil M., Pinhasi R. (2024)
Link between Monkeypox Virus Genomes from Museum Specimens and 1965 Zoo Outbreak
Emerging Infectious Diseases, 30 (4)

Zemella A., Beer K., Ramm F., Wenzel D., Düx A., Merkel K., Calvignac-Spencer S., Stern D., Dorner M.B., Dorner B.G., Widulin N., Schnalke T., Walter C., Wolbert A., Schmid B.G., ... , Mankertz A., Santibanez S. (2024)
Vaccine-induced neutralizing antibodies bind to the H protein of a historical measles virus
Int.J.Med.Microbiol., 314 (March 2024)

Aghebatrafat A.A., Lauber C., Merkel K., Fruth B., Langergraber K., Robbins M.M., Wittig R.M., ... , Leendertz F.H., Calvignac-Spencer S. (2023)
Evolutionary Insight into the Association between New Jersey Polyomavirus and Humans
Viruses, 15 (11)

Danabalan R., Merkel K., Baerholm Schnell I., Arandjelovic M., Boesch C., Brazzola G., Dieguez P., Dupain J., Kambale-Vyalengerera M., Kühl H.S., Hoffmann C., Lapuente J., Ngoc Thinh V., Zimmermann F., Leendertz F.H., Gilbert M.T.P., Roos C., Mazzoni C., ... , Gogarten J.F., Calvignac-Spencer S. (2023)
Mammal mitogenomics from invertebrate-derived DNA
Environ.DNA.

Lynggaard C., Calvignac-Spencer S., Chapman C.A., Kalbitzer U., Leendertz F.H., Omeja P.A., Opito E.A., Sarkar D., ... , Bohmann K., Gogarten J.F. (2023)
Vertebrate environmental DNA from leaf swabs
Curr.Biol., 33 (16)

Jahan M., Lagostina L., Gräßle T., Couacy-Hymann E., Kouadio L., Kouakou V.K., Krou H.A., Mossoun A.M., Patrono L.V., Pleh K., Steiner J.A., Yves N., Leendertz F.H., ... , Calvignac-Spencer S., Gogarten J.F. (2023)
Fly iDNA suggests strict reliance of the causative agent of sylvatic anthrax on rainforest ecosystems
Environmental DNA

Anoh E.A., Wayoro O., Monemo P., Belarbi E., Sachse A., Wilkinson E., San J.E., Leendertz F.H., Diané B., Calvignac-Spencer S., ... , Akoua-Koffi C., Schubert G. (2023)
Subregional origins of emerging SARS-CoV-2 variants during the second pandemic wave in Côte d'Ivoire
Virus Genes

Jahan M., Calvignac-Spencer S., Chapman C.A., Kalbitzer U., Leendertz F.H., Omeja P.A., Sarkar D., ... , Ulrich M., Gogarten J.F. (2023)
The Movement of Pathogen Carrying Flies at the Human-Wildlife Interface
EcoHealth

Gogarten J.F., Jahan M., Calvignac-Spencer S., Chapman C.A., Goldberg T.L., ... , Leendertz F.H., Rothman J.M. (2022)
The cost of living in larger primate groups includes higher fly densities
EcoHealth, 19 (2)

Patrono L.V., Röthemeier C., Kouadio L., Couacy-Hymann E., Wittig R.M., ... , Calvignac-Spencer S., Leendertz F.H. (2022)
Non-invasive genomics of respiratory pathogens infecting wild great apes using hybridisation capture
Influ.Other Respir.Viruses, 16 (5)

Plenderleith L.J., Liu W., Li Y., Loy D.E., Mollison E., Connell J., Ayouba A., Esteban A., Peeters M., Sanz C.M., Morgan D.B., Wolfe N.D., Ulrich M., Sachse A., Calvignac-Spencer S., Leendertz F.H., Shaw G.M., ... , Hahn B.H., Sharp P.M. (2022)
Zoonotic origin of the human malaria parasite Plasmodium malariae from African apes
Nat.Commun., 13 (1)

Hockings K.J., Mubemba B., Avanzi C., Pleh K., Düx A., Bersacola E., Bessa J., Ramon M., Metzger S., Patrono L.V., Jaffe J.E., Benjak A., Bonneaud C., Busso P., Couacy-Hymann E., Gado M., Gagneux S., Johnson R.C., Kodio M., Lynton-Jenkins J., Morozova I., Mätz-Rensing K., Regalla A., Said A.R., Schuenemann V.J., Sow S.O., Spencer J.S., Ulrich M., Zoubi H., Cole S.T., Wittig R.M., ... , Calvignac-Spencer S., Leendertz F.H. (2021)
Leprosy in wild chimpanzees
Nature, 598 (7882)