Wellplatte

Human-Microbe Systems Bioinformatics

Im menschlichen Körper gibt es wesentlich weniger menschliche Zellen als Mikroben. Letztere stehen sowohl mit dem Wirt als auch untereinander in ständiger Wechselwirkung und können die Gesundheit und das Wohlbefinden des Einzelnen stark beeinflussen. In unserer Gruppe entwickeln wir hochmoderne Bioinformatik-Software und wenden sie an, um die Zusammenhänge zwischen Mensch und Mikroben genauer zu untersuchen und Naturstoffe zu entdecken, die an der Kommunikation zwischen den beiden Welten beteiligt sind. Diese Gruppe hat ihren Sitz am Helmholtz-Institut für Pharmazeutische Forschung Saarland (HIPS).

Jun.-Prof. Dr. Alexey Gurevich

Leitung

Jun.-Prof. Dr. Alexey Gurevich
Forschungsgruppenleiter

Unsere Forschung

Naturstoffe sind eine vielversprechende Quelle für neue Arzneimittel, wie z. B. Antiinfektiva. Sie vermitteln Wechselwirkungen zwischen Mikroben und menschlichen Zellen und können Ärzten als Biomarker für Gesundheit und Krankheit dienen. Dank bahnbrechender Fortschritte in der "Omics"-Technologie konnten zügig umfangreiche Daten über Naturstoffe und ihre Produzenten gesammelt werden, doch die computergestützte Analyse und Interpretation dieser Daten ist nach wie vor eine spannende Herausforderung.

Unser Ziel ist es, die Entdeckung von Naturstoffen in einen Prozess der Hochdurchsatztechnologie umzuwandeln, indem wir problemspezifische Algorithmen entwickeln und testen. Eine enge interdisziplinäre Zusammenarbeit mit Informatikern und Naturstoffexperten macht unsere Software robust, effizient und für eine breite Forschungsgemeinschaft anwendbar. Insbesondere der Zugang zu einzigartigen Single- und Multi-omics-Datensätzen, die im Rahmen von Kooperationsprojekten zur Verfügung stehen, stellt eine sprichwörtliche Goldmine für die Validierung und Feinabstimmung der Tools dar und führt letztendlich zu biomedizinisch relevanten Entdeckungen und einem besseren Verständnis der komplexen Mensch-Mikroben-Systeme.