Unsere Forschung
In verschiedenen Projekten untersuchen wir das Zusammenspiel von genetischem Hintergrund und Umwelteinflüssen und deren Beitrag zu Infektionen und immunologischen Erkrankungen. Wir konzentrieren uns auf die Anwendung und Entwicklung computergestützter und statistischer Ansätze zur Untersuchung der Wirkung genetischer Faktoren auf verschiedene molekulare Ebenen (wie Genetik, Genomik, Metabolomik), immunologische Parameter und deren Funktionen sowie auf komplexe Krankheiten. Wir arbeiten derzeit an den folgenden Bereichen:
Genetische Regulation molekularer und immunologischer Phäntotypen
Wir untersuchen, wie genetische Variation molekulare und immunologische Phänotypen wie bspw. Genexpression, Metabolite und Zytokinreaktionen auf verschiedene Stimulationen hin beeinflusst. Wir entwickeln Berechnungsmethoden und Algorithmen, um Hochdurchsatz-Datensätze aus den state-of-the-art Technologien vollständig zu nutzen, z.B. kausale Inferenz und Dekonvolution der gesamten genetischen Regulationseffekte der Genexpression in relevanten Zelltypen.
Integration von Multi-Omics
Wir integrieren große Multiomics-Datensätze und Immunprofile von Patienten- und Kontrollkohorten, um die Genotyp-Phänotyp-Zusammenhänge im genomweiten Maßstab zu entschlüsseln. Darauf aufbauend erstellen wir Computermodelle zur Vorhersage von Immunfunktionen und Krankheitsrisiken.
Einzelzell-Genomik
Wir wenden modernste Techniken an, um die genetische Regulation der Genexpression als Reaktion auf Reize bei der Einzelzellauflösung zu untersuchen. Weiterhin entwickeln wir neue Berechnungsansätze für die Einzelzellbiologie.
Für Informationen zu aktuellen Projekten besuchen Sie bitte die CiiM-Webseite
Unsere Forschung
In verschiedenen Projekten untersuchen wir das Zusammenspiel von genetischem Hintergrund und Umwelteinflüssen und deren Beitrag zu Infektionen und immunologischen Erkrankungen. Wir konzentrieren uns auf die Anwendung und Entwicklung computergestützter und statistischer Ansätze zur Untersuchung der Wirkung genetischer Faktoren auf verschiedene molekulare Ebenen (wie Genetik, Genomik, Metabolomik), immunologische Parameter und deren Funktionen sowie auf komplexe Krankheiten. Wir arbeiten derzeit an den folgenden Bereichen:
Genetische Regulation molekularer und immunologischer Phäntotypen
Wir untersuchen, wie genetische Variation molekulare und immunologische Phänotypen wie bspw. Genexpression, Metabolite und Zytokinreaktionen auf verschiedene Stimulationen hin beeinflusst. Wir entwickeln Berechnungsmethoden und Algorithmen, um Hochdurchsatz-Datensätze aus den state-of-the-art Technologien vollständig zu nutzen, z.B. kausale Inferenz und Dekonvolution der gesamten genetischen Regulationseffekte der Genexpression in relevanten Zelltypen.
Integration von Multi-Omics
Wir integrieren große Multiomics-Datensätze und Immunprofile von Patienten- und Kontrollkohorten, um die Genotyp-Phänotyp-Zusammenhänge im genomweiten Maßstab zu entschlüsseln. Darauf aufbauend erstellen wir Computermodelle zur Vorhersage von Immunfunktionen und Krankheitsrisiken.
Einzelzell-Genomik
Wir wenden modernste Techniken an, um die genetische Regulation der Genexpression als Reaktion auf Reize bei der Einzelzellauflösung zu untersuchen. Weiterhin entwickeln wir neue Berechnungsansätze für die Einzelzellbiologie.
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Prof. Dr. Yang Li
Menschen unterscheiden sich in ihrem genetischen Hintergrund. Wir untersuchen diese interindividuelle Variation und wollen die Anfälligkeit für Infektionen verstehen und das Krankheitsrisiko vorhersagen
Yang Li promovierte 2010 an der Universität Groningen, Niederlande, in Bioinformatik. Sie setzte ihre Karriere als Postdoc am Groningen Bioinformatics Centre fort und erhielt 2011 den Young Investigator Award of Bioinformatics vom Netherlands Bioinformatics Centre.
Danach wurde sie Principal Investigator/Assistenzprofessorin in der Abteilung für Genetik am University Medical Centre Groningen. Ihre erfolgreiche Forschung zur Systemgenetik von immunbezogenen Krankheiten wurde mit zwei persönlichen Stipendien ausgezeichnet: dem VENI (Niederländische Organisation für wissenschaftliche Forschung, 2013) und dem Off-Road (Niederländische Organisation für Gesundheitsforschung und Entwicklung, 2016). Im Jahr 2018 erhielt Yang Li den renommierten "Hypatia Grant" des Radboud University Medical Center.
Seit 2019 leitet Yang Li die Abteilung „Bioinformatik der Individualisierten Medizin“ am Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung (HZI) / Zentrum für Individualisierte Infektionsmedizin (CiiM) in Hannover.
Ausgewählte Publikationen
Eine vollständige Liste der Publikationen von Yang Li finden Sie bei Google Scholar
Stellenangebote
Die Abteilung "Bioinformatik der Individualisierten Medizin" begrüßt Bewerbungen von qualifizierten Kandidat:innen für eine Doktoranden- oder Postdoc-Stelle. Informieren Sie sich hier über offene Stellen. Auch Initiativbewerbungen sind immer willkommen.
Wir suchen motivierte Bewerber:innen mit einem fundierten Verständnis von Bioinformatik / Computational Biology, Informatik, Statistik, Biologie oder Physik, guten Programmierkenntnissen und Interesse an interdisziplinärer Forschung in der Biologie und Infektionsforschung.
Unsere Forschung beschäftigt sich mit dem Verständnis der interindividuellen Variation in der Anfälligkeit für immunbezogene Krankheiten und der Vorhersage von Immunfunktionen durch die Integration von großen Multi-omics und detaillierten Immunphänotypen-Datensätzen aus einer Vielzahl von bestehenden und geplanten Patientenkohorten.
Die Methoden, die wir in unserer Forschung einsetzen oder entwickeln, stammen aus den Bereichen Bioinformatik, Systemgenetik, Maschinelles Lernen & Deep Learning und Systemimmunologie.
Bitte senden Sie Ihre Bewerbungen an Yang Li.
Wir bieten laufend Master/Bachelor-Forschungsprojekte an. Für Einzelheiten nehmen Sie bitte per E-Mail Kontakt mit uns auf.
