HZI-Forscher:innen unterhalten sich im Labor

Postdoc (m/w/d)

Kennziffer: 081/2024
Forschungsgruppe
Evolutionäre Gemeinschaftsökologie
Einstellungszeitpunkt
Zum nächstmöglichen Zeitpunkt
Befristung
Der Vertrag hat zunächst eine Laufzeit von zwei Jahren. Eine Verlängerung ist möglich.
Probezeit
6 Monate
Vergütung
E14 TVöD Bund
Bewerbungsfrist
01.07.2024

Das HIOH sucht zum nächstmöglichen Zeitpunkt einen/eine Postdoc in der Abteilung EVCO.

Das Helmholtz-Institut für One Health (HIOH), ein Standort des Helmholtz-Zentrums für Infektionsforschung (HZI) in Greifswald, will die Zusammenhänge zwischen der Gesundheit von Mensch, Tier und Umwelt erforschen. Unser Ziel ist es, ein besseres Verständnis von zoonotischen Krankheiten, antimikrobiellen Resistenzen und der Evolution von Krankheitserregern zu erlangen - entscheidende Eckpfeiler für die Entwicklung von Pandemievorsorge und Prävention. Das Institut wurde 2021 gegründet und beherbergt internationale und interdisziplinäre Forschungsteams, die ein Zentrum für innovative One-Health-Forschung an der Ostsee bilden.

Die Evolutionary Community Ecology Group (EVCO) will dazu beitragen, eine Grundlage für eine Erhaltungspolitik zu schaffen, die auf ein nachhaltiges Leben mit der biologischen Vielfalt abzielt, indem sie einerseits die Prozesse versteht, die die tierische und mikrobielle Vielfalt in Ökosystemen beeinflussen und aufrechterhalten, und andererseits zur Entwicklung von Strategien zum Verständnis und zur Eindämmung der Entstehung von Krankheiten in menschlichen und wildlebenden Populationen beiträgt. Zu diesem Zweck entwickelt sie ein Umwelt-DNA-Toolkit zur Untersuchung von Wirten und Krankheitserregern auf Landschaftsebene sowie nicht-invasive Ansätze zur Gewinnung genomischer Daten von Wirten, ihren Symbionten und Krankheitserregern.

Jedes Säugetier beherbergt Billionen von Mikroorganismen; der Mensch bildet da keine Ausnahme. Diese Gemeinschaften machen einen Großteil der Zellen eines Wirts aus und umfassen Bakterien, Archaeen, mikrobielle Eukaryonten sowie viele Viren (einschließlich bakterieninfizierender Bakteriophagen; im Folgenden Phagen). Die am häufigsten vorkommenden und vielfältigsten Gemeinschaften befinden sich im Darm, und ihre Zusammensetzung steht in Zusammenhang mit menschlichen Krankheiten und dem langfristigen Sterberisiko. Phagen haben das Potenzial, die Struktur und Funktion dieser Ökosysteme und damit letztlich auch die menschliche Gesundheit zu beeinflussen. Trotz ihrer potenziellen Bedeutung sind die ökologischen und evolutionären Prozesse, die zur Entstehung des modernen menschlichen Phageoms geführt haben, nach wie vor nur unzureichend geklärt. Studien an nicht-menschlichen Primaten haben das Potenzial, Einblicke in die Evolutionsgeschichte des menschlichen Phageoms und in die ökologischen Prozesse zu geben, die diese Gemeinschaften vor den jüngsten Veränderungen in der Lebensweise des Menschen geformt haben.

Für ein gemeinsames Projekt mit Dr. Susanne Sievers an der Universität Greifswald sucht EVCO eine/n Post-Doc, der/die dazu beiträgt, diese Wissenslücken zu schließen, indem er/sie die Darm-Phageome unserer nächsten lebenden Verwandten untersucht und gleichzeitig Phagen als Werkzeug entwickelt, um die Übertragungsraten von Mikroorganismen an der Schnittstelle zwischen Mensch und Wildtier zu untersuchen und ihre Verwendung als therapeutische Wirkstoffe zu erforschen (für Details; proposal10.1093/emph/eoac00610.1073/pnas.2013535118). Dies beinhaltet die Arbeit mit äußerst einzigartigen Datensätzen (z. B. 20-jährige Längsschnittproben von wildlebenden Schimpansen; Kotproben aus der gesamten Primatenphylogenie; Proben von der Schnittstelle zwischen Mensch und Tier). Wir suchen einen Kandidaten mit bioinformatischen Kenntnissen und Interesse an der Entwicklung von Instrumenten zur Beschreibung bisher unbeschriebener Phagengemeinschaften. Erfahrungen mit phylogenetischen Ansätzen zur Rekonstruktion der Evolutionsgeschichte von Organismen und zur Erforschung von Mustern der Ko-Divergenz und der Übertragungsgeschichte wären ein großer Vorteil. Laborerfahrung mit der Isolierung von Phagen und dem Testen ihrer Wirksamkeit gegen resistente Isolate wäre ebenfalls eine nützliche Qualifikation für das Projekt. Erfahrungen mit der Erstellung von Bibliotheken für die Hochdurchsatz-Sequenzierung und der Verwendung von Hybridisierungs-Capture zur Anreicherung von Zielmolekülen wären von Vorteil, da wir über eine Sammlung von Köder-Sets verfügen, die auf verschiedene Gruppen von Phagen abzielen.  

Obwohl der ideale Kandidat all diese Fähigkeiten mitbringt, bieten wir die Möglichkeit, fehlende Fähigkeiten zu erlernen, und die Abteilung für mikrobielle Physiologie und Molekularbiologie der Universität Greifswald sowie das Helmholtz-Institut für One Health bieten ein Team mit vielfältiger Expertise und Ressourcen, die fehlende Fähigkeiten ergänzen könnten. Darüber hinaus wird ein Doktorand für dieses Projekt eingestellt, der Aspekte des Projekts übernehmen kann, die von dem Post-Doc nicht abgedeckt werden können, insbesondere die Laborarbeiten zur Isolierung von Phagen.

Aufgaben
  • Entwicklung und Anwendung von Werkzeugen zur Beschreibung bisher unbeschriebener Phagengemeinschaften aus Shotgun-Metagenomen 
  • Beschreibung der Phagenübertragung innerhalb und zwischen Arten an der Schnittstelle zwischen Mensch und Wildtier unter Verwendung einer Kombination von Shotgun-Metagenomen und Anreicherungsexperimenten auf der Grundlage von Hybridisierungserfassung
  • Zusammenarbeit mit dem Doktoranden des Projekts zur Erforschung des Potenzials, Phagen aus Kotproben von Wildtieren zu isolieren und sie gegen resistente bakterielle Isolate zu testen
Voraussetzungen
  • Abgeschlossene Promotion in Biologie, Bioinformatik, Mikrobiologie oder verwandten Disziplinen 
  • Erfahrung im Umgang mit großen Sequenzdatensätzen
  • Gute Kenntnisse in molekularbiologischen Labortechniken 
  • Hohe Motivation und Organisationstalent
  • Fließende Beherrschung der englischen Sprache in Wort und Schrift
  • Gute Schreib- und Präsentationsfähigkeiten
Arbeitszeit

39 Stunden pro Woche

Wir bieten Ihnen

  • Eine spannende, abwechslungsreiche Tätigkeit in einem zukunftsorientierten Forschungsinstitut in einem internationalen wissenschaftlichen Umfeld und viele Möglichkeiten zum Aufbau anregender lokaler Kooperationen zu anderen Themen (z.B. Krankheitsökologie und -evolution, Umwelt-DNA, alte DNA/RNA, Antibiotikaresistenz)
  • Moderne Forschungslabore und Instrumente auf dem neuesten Stand der Technik
  • Eine Unternehmenskultur der Wertschätzung und Förderung der Chancengleichheit
  • Umfangreiche Aus- und Weiterbildungsmöglichkeiten zur Entwicklung von Fachwissen und persönlichen Fähigkeiten
  • Ein Familienbüro zur Unterstützung von Familie und Beruf sowie Kinderbetreuungsangebote
  • Interessante Zusatzleistungen des öffentlichen Dienstes
  • Bezuschussung des Jobtickets

Bei gleicher fachlicher Eignung erhalten Schwerbehinderte den Vorzug. Zur Wahrung Ihrer Rechte bitten wir Sie, uns bereits in Ihrem Anschreiben oder Lebenslauf einen gut erkennbaren Hinweis auf das Vorliegen eines Grades einer Schwerbehinderung zu geben.

Die Anstellung erfolgt über das Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung in Braunschweig. Der Arbeitsort ist Greifswald.

Das HZI setzt sich aktiv für Gleichstellung, Vielfalt und Integration ein. Daher verfolgt das HZI das Ziel der beruflichen Gleichstellung von Frauen und Männern und begrüßt ausdrücklich Bewerbungen von qualifizierten Frauen. Die Stelle ist für eine Teilzeitbeschäftigung geeignet.

 

So bewerben Sie sich

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Bitte fügen Sie Ihren Bewerbungsunterlagen ein Anschreiben, einen Lebenslauf, (Arbeits-) Zeugnisse, Zertifikate und (wenn vorhanden) Arbeitsproben oder Referenzprojekte bei. Bitte verzichten Sie auf die Einsendung eines Fotos.

Ihre Unterlagen senden Sie bitte unter Angabe der Kennziffer 081/2024 an das Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung GmbH, Personalabteilung, Inhoffenstr. 7, 38124 Braunschweig oder per E-Mail. Bei Zusendung Ihrer Bewerbung in elektronischer Form bitten wir um Zusammenfassung in einem (1) PDF-Dokument.

Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung!

Dr. Jan Frederik Gogarten

Kontakt

Dr. Jan Frederik Gogarten

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