Mikrobielle Interaktionen und Prozesse

Mikroorganismen leben in ihren natürlichen Lebensräumen in komplexen Gemeinschaften und auch der menschliche Körper ist ein solcher Lebensraum. Wir sind von Bakterien in solchen Mengen besiedelt, dass sie die Zahl der menschlichen Zellen weit übersteigt. Diese wirtsassoziierten Mikroorganismen können unsere Gesundheit fördern – oder ein Reservoir für Krankheitserreger sein.


Ausgewählte Publikationen

Blasco R, Wittich RM., Mallavarapu M, Timmis KN, Pieper DH (1995) From xenobiotic to antibiotic, formation of protoanemonin from 4-chlorocatechol by enzymes of the 3-oxoadipate pathway. J Biol Chem 270:29229-29235

Beil S, Mason J, Timmis KN, Pieper DH (1998) Identification of chlorobenzene dioxygenase sequence elements involved in dechlorination of 1,2,4,5-tetrachlorobenzene. J Bacteriol 180:5520-5528

Junca H, Pieper DH (2004) Functional gene diversity analysis in BTEX contaminated soils by means of PCR-SSCP DNA fingerprinting: comparative diversity assessment against bacterial isolates and PCR-DNA clone libraries. Environ Microbiol 6:95-110

Wos-Oxley M, Plumeier I, von Eiff C, Taudien S, Platzer M, Vilchez-Vargas R, Becker K, Pieper DH (2010) A poke into the diversity and associations within human anterior nare microbial communities. ISME J 4:839-851

Vilchez-Vargas R, Geffers R, Suárez-Diez M, Conte I, Waliczek A, Kaser VS, Kralova M, Junca H, Pieper DH (2013) Analysis of the microbial gene landscape and transcriptome for aromatic pollutants and alkane degradation using a novel internally calibrated microarray system. Environ Microbiol 15:1016-1039


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  • Autoren: Duarte,M.; Nielsen,A.; Camarinha-Silva,A.; Vilchez-Vargas,R.; Bruls,T.; Wos-Oxley,M.L.; Jauregui,R.; Pieper,D.H.; ( Jahr: 2017). Title: Functional soil metagenomics: Elucidation of polycyclic aromatic hydrocarbon degradation potential following 12 years of in situ bioremediation. Zeitschrift: Environmental Microbiology DOI: 10.1111/1462-2920.13756 PubMed
  • Autoren: Amitay,E.L.; Werner,S.; Vital,M.; Pieper,D.H.; Hofler,D.; Gierse,I.J.; Butt,J.; Balavarca,Y.; Cuk,K.; Brenner,H.; ( Jahr: 2017). Title: Fusobacterium and colorectal cancer: Causal factor or passenger? Results from a large colorectal cancer screening study. Zeitschrift: Carcinogenesis Band: 38 Issue: 8, S-Seite: 781- E-Seite: 788 DOI: 10.1093/carcin/bgx053 PubMed
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  • Autoren: Heidrich,B.; Vital,M.; Plumeier,I.; Doscher,N.; Kahl,S.; Kirschner,J.; Ziegert,S.; Solbach,P.; Lenzen,H.; Potthoff,A.; Manns,M.P.; Wedemeyer,H.; Pieper,D.H.; ( Jahr: 2017). Title: Intestinal microbiota in patients with chronic hepatitis C with and without liver cirrhosis compared to healthy controls. Zeitschrift: Liver Int. DOI: 10.1111/liv.13485 PubMed
  • Autoren: Truchado,P.; Hernandez-Sanabria,E.; Salden,B.N.; Van den Abbeele,P.; Vilchez-Vargas,R.; Jauregui,R.; Pieper,D.H.; Possemiers,S.; Van De Wiele,T.; ( Jahr: 2017). Title: Long chain arabinoxylans shift the mucosa-associated microbiota in the proximal colon of the simulator of the human intestinal microbial ecosystem (M-SHIME). Zeitschrift: J.Funct.Foods Band: 32, S-Seite: 226- E-Seite: 237 DOI: 10.1016/j.jff.2017.02.004 WEBURLS
  • Autoren: Babbar,A.; Kumar,V.N.; Bergmann,R.; Barrantes,I.; Pieper,D.H.; Itzek,A.; Nitsche-Schmitz,D.P.; ( Jahr: 2017). Title: Members of a new subgroup of Streptococcus anginosus harbor virulence related genes previously observed in Streptococcus pyogenes. Zeitschrift: International Journal of Medical Microbiology Band: 307 Issue: 3, S-Seite: 174- E-Seite: 181 PubMed
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  • Autoren: Gottschick,C.; Deng,Z.L.; Vital,M.; Masur,C.; Abels,C.; Pieper,D.H.; Wagner-Döbler,I.; ( Jahr: 2017). Title: The urinary microbiota of men and women and its changes in women during bacterial vaginosis and antibiotic treatment. Zeitschrift: Microbiome. Band: 5 Issue: 1, S-Seite: 99 DOI: 10.1186/s40168-017-0305-3 HZI-Repositorium PubMed
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  • Autoren: Van den Bossche,L.; Hindryckx,P.; Devisscher,L.; Devriese,S.; Van Welden,S.; Holvoet,T.; Vilchez-Vargas,R.; Vital,M.; Pieper,D.H.; Bussche,J.V.; Vanhaecke,L.; Van De Wiele,T.; De Vos,M.; Laukens,D.; ( Jahr: 2017). Title: Ursodeoxycholic acid and its taurine- or glycine-conjugated species reduce colitogenic dysbiosis and equally suppress experimental colitis in mice. Zeitschrift: Appl.Environ.Microbiol. Band: 83 Issue: 7 DOI: 10.1128/AEM.02766-16 HZI-Repositorium PubMed
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  • Autoren: Courtens,E.N.; Spieck,E.; Vilchez-Vargas,R.; Bode,S.; Boeckx,P.; Schouten,S.; Jauregui,R.; Pieper,D.H.; Vlaeminck,S.E.; Boon,N.; ( Jahr: 2016). Title: A robust nitrifying community in a bioreactor at 50 degrees C opens up the path for thermophilic nitrogen removal. Zeitschrift: ISME J Band: 10 Issue: 9, S-Seite: 2293- E-Seite: 2303 PubMed
  • Autoren: Yakimov,M.M.; Crisafi,F.; Messina,E.; Smedile,F.; Lopatina,A.; Denaro,R.; Pieper,D.H.; Golyshin,P.N.; Giuliano,L.; ( Jahr: 2016). Title: Analysis of defence systems and a conjugative IncP-1 plasmid in the marine polyaromatic hydrocarbons-degrading bacterium Cycloclasticus sp. 78-ME. Zeitschrift: Environ.Microbiol.Rep. Band: 8 Issue: 4, S-Seite: 508- E-Seite: 519 DOI: 10.1111/1758-2229.12424 HZI-Repositorium PubMed
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  • Autoren: Verstraelen,H.; Vilchez-Vargas,R.; Desimpel,F.; Jauregui,R.; Vankeirsbilck,N.; Weyers,S.; Verhelst,R.; De,Sutter P.; Pieper,D.H.; Van de,Wiele T.; ( Jahr: 2016). Title: Characterisation of the human uterine microbiome in non-pregnant women through deep sequencing of the V1-2 region of the 16S rRNA gene. Zeitschrift: PeerJ Band: 4, S-Seite: e1602 DOI: 10.7717/peerj.1602 HZI-Repositorium PubMed
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  • Autoren: Perez-Pantoja,D.; Gonzalez,B.; Pieper,Dietmar H.*; ( Jahr: 2009). Title: Phylogenomics of aerobic bacterial degradation of aromatics. Buchtitel: Handbook of Hydrocarbon and Lipid Microbiology Herausgeber: Timmis,K.N.; (Ed.). Verlag: Springer, S-Seite: 1356- E-Seite: 1391
  • Autoren: Vílchez,R.; Pozo,C.; Gómez,M.A.; Rodelas,B.; Gonzáles-López,J.; ( Jahr: 2007). Title: Dominance of sphingomonads in a copper-exposed biofilm community for groundwater water treatment. Zeitschrift: Microbiology Band: 153 Issue: 2, S-Seite: 325- E-Seite: 337 DOI: Article WEBURLS


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  • Darmbakterien mit Einfluss auf Herz und Kreislauf

    Darmbakterien stehen unter dem Verdacht, Herz-Kreislauferkrankungen zu verursachen, da sie ein für den Menschen gefährliches Stoffwechselprodukt produzieren. Bisher sind diese Zusammenhänge allerdings noch vage. Etwas Licht ins Dunkel bringt ein HZI-Forschungsteam. Was es jetzt entdeckt hat, fasst Marius Vital in einer Minute zusammen.

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  • Staphylococcus aureus – der Feind in meiner NaseEin kräftiger Nieser und der Luftdruck katapultiert Millionen von Bakterien aus unserer Nase. Auch wenn wir keinen Schnupfen haben. Ein häufiger Nasenbewohner ist Staphylococcus aureus und wenn der mit dem Luftstoß zufällig auf eine Wunde trifft, haben wir ein Problem… Dietmar Pieper und sein Team wollen wissen, wer noch so alles in unserer Nase lebt – und was wir gegen unerwünschte Bewohner wie Staphylococcus aureus unternehmen können.
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