Bioinformatik der Infektionsforschung

Die Gruppe konzentriert sich in ihrer Forschung auf die Daten-getriebene Analyse von biologischen Fragestellungen aus der Infektionsforschung sowie auf die Entwicklung von neuen Methoden für die Analyse von großen biologischen Datensätzen.

Leitung

Webanwendungen

Traitar  ist ein Web- Service für die Phänotypisierung von Bakterien basierend auf ihren genomischen Sequenzen. 

PhyloPythiaS+ - eine selbst-trainierende Methode für die rapide Rekonstruktion von Gruppen mit niedriger taxonomischer Stufe aus Metagenomen.

PhyloPythiaS  – der PhyloPythiaS Web- Server für die taxonomische Einordnung von metagenomischen Sequenzen.

Taxator-tk  führt eine taxonomische Einordnung durch mittels schneller, approximativer Bestimmung von evolutionären Nachbarn basierend auf Sequenzähnlichkeiten.

AdaPatch  ist eine Methode zur Detektion von positiv selektierten Regionen auf der Oberfläche von viralen Proteinen, die relevant für die adaptive Evolution sein können.

Software Downloads

In der Gruppe entwickelte und implementierte Software kann hier herunter geladen werden.

News

Video

  • Kann man die nächste Grippe-Epidemie vorhersagen?

    Es antwortet Dr. Andreas Bremges, stellv. Abteilungsleiter Bioinformatik der Infektionsforschung am HZI in Braunschweig.

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