LncRNA und Infektionsbiologie

Um Infektionskrankheiten erfolgreich bekämpfen zu können, benötigen wir neuartige Ansätze zum Verständnis der biologischen Mechanismen von Infektionen. Traditionell liegt der Fokus bei der Erforschung der Immunantwort infizierter Zellen auf der Aktivität von Transkriptionsfaktoren. In den letzten Jahren rücken jedoch auch nicht-kodierende RNAs immer stärker als potente Regulatoren in den Fokus: Hunderte „lange nicht-kodierende RNAs“ (lncRNAs), die Boten-RNAs ähneln, jedoch nicht als Vorlage für die Proteinsynthese fungieren, werden in infizierten Zellen spezifisch reguliert. Es ist bereits bekannt, dass einzelne lncRNAs für die Steuerung der Wirtsantwort von Bedeutung sind – die zugrundeliegenden Funktionsmechanismen solcher lncRNA Regulatoren sind bisher jedoch weitgehend unerforscht. Unsere Forschungsgruppe nutzt neuste Methoden aus den Feldern der Biochemie, Genetik und Bioinformatik um die Funktionsmechanismen von lncRNAs in Infektionskrankheiten zu entschlüsseln und diese für die Entwicklung von RNA-basierten Therapieansätzen nutzbar zu machen.

Leitung

Publikationen

*co-first author, #co-corresponding author

Munschauer, M.#, Nguyen, C.T., Sirokman, K., Hartigan C. R., Hogstrom, L., Engreitz, J. M, Fulco, C. P., Subramanian V., Chen, J., Ulirch J. C., Schenone, M. Guttman, M., Carr, S.A. Lander, E. S.# (2018). The NORAD lncRNA assembles a topoisomerase complex critical for genome stability. Nature, 561(7721):132-136. doi.org/10.1038/s41586-018-0453-z

Munschauer, M. and Vogel, J. (2018) Nuclear lncRNA stabilization in the host response to bacterial infection. EMBO J, 37(13). pii: e99875. doi.org/10.15252/embj.201899875.

Khajuria R.K., Munschauer, M., Ulirsch J.C., Fiorini C., Ludwig L.S., McFarland S.K., Abdulhay N.J., Specht H., Keshishian H., Mani D.R., Jovanovic M., Ellis S.R., Fulco C.P., Engreitz J.M., Schütz S., Lian J., Gripp K.W., Weinberg O.K., Pinkus G.S., Gehrke L., Regev A., Lander E.S., Gazda H.T., Lee W.Y., Panse V.G., Carr S.A., Sankaran V.G. (2018). Ribosome Levels Selectively Regulate Translation and Lineage Commitment in Human Hematopoiesis. Cell, 173(1):90-103.e19. doi.org/10.1016/j.cell.2018.02.036

Fulco, C. P., Munschauer, M., Anyoha, R., Munson, G., Grossman, S. R., Perez, E. M., Kane, M., Cleary B., Lander E. S., Engreitz E. M. (2016). Systematic mapping of functional enhancer-promoter connections with CRISPR interference. Science, 354(6313):769-773. doi.org/10.1126/science.aag2445

Baltz, A.G.*, Munschauer, M.*, Schwanhaeusser, B., Vasile, A., Murakawa, Y., Schueler, M., Youngs, N., Penfold-Brown, D., Drew, K., Milek, M., Wyler, E., Bonneau, R., Selbach, M., Dieterich, C., and Landthaler, M. (2012). The mRNA-bound proteome and its global occupancy profile on protein-coding transcripts. Molecular Cell 46(5):674-90. doi.org/10.1016/j.molcel.2012.05.021

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