Genomarchitektur und Evolution von RNA-Viren

RNA-Viren stellen eine ernsthafte Bedrohung für die Gesundheit des Menschen dar und sind für Millionen von Todesfällen jedes Jahr verantwortlich. Das RNA-Genom steuert die Replikation dieser Viren und kodiert für eine Vielzahl von viralen Proteinen, die für die erfolgreiche Infektion einer Wirtszelle essentiell sind. Klassischerweise konzentriert sich die Infektionsforschung darauf, die beteiligten Virusproteine in ihrer Funktion zu hemmen und dadurch deren Replikation zu unterbinden. Inzwischen weiß man jedoch, dass das RNA-Genom nicht nur als passiver Informationsträger für virale Proteine fungiert, sondern durch die Tätigkeit von nicht-kodieren RNAs aktiven Einfluss auf die Replikation nimmt. Wir untersuchen die Struktur und Funktion von viralen nicht-kodierenden RNAs, mit dem Ziel unsere neu gewonnenen Erkenntnisse für die Entwicklung von zukunftsweisenden RNA-basierten Therapieansätzen einzusetzen.

Leitung

Ausgewählte Publikationen

Smyth RP§*, Smith MR*, Jousset AC, Despons L, Laumond G, Decoville T, Cattenoz P, Moog C, Jossinet F, Mougel M, Paillart JC, von Kleist M§, Marquet R§ (2018)
In cell mutational interference mapping experiment (in cell MIME) identifies the 5′ polyadenylation signal as a dual regulator of HIV-1 genomic RNA production and packaging
Nucleic Acids Research 46(9), e57

Mailler E, Bernacchi S, Vivet-Boudou V, Paillart JC, Marquet R, Smyth RP§ (2016) 
The life-cycle of the HIV-1 gag-RNA complex
Viruses 8(9)

Smyth RP§, Despons L, Huili G, Bernacchi S, Hijnen M, Mak J, Jossinet F, Weixi Li, Paillart Jean-Christophe, von Kleist M§, Marquet R§ (2015)
Mutational Interference Mapping Experiment (MIME) for studying the relationship between RNA structure and function
Nature Methods 12(9):866-72

Abd El-Wahab EW*, Smyth RP*, Mailler E, Bernacchi S, Vivet-Boudou V., Hijnen M, Jossinet F, Mak J, Paillart JC, Marquet R (2014)
Specific recognition of the HIV-1 genomic RNA by the Gag precursor
Nature Communications 5:4304.

Gavazzi C, Yver M, Isel C, Smyth RP, Rosa-Calatrava M, Lina B, Moules V, Marquet R (2013)
A functional sequence-specific interaction between influenza A virus genomic RNA segments
PNAS 110(41):16604-9. 

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