Bioinformatik der Infektionsforschung
Die Abteilung “Bioinformatik der Infektionsforschung” erforscht mit computergestützten Techniken das menschliche Mikrobiom, virale und bakterielle Pathogene sowie menschliche Zelllinien anhand von großen biologischen und epidemiologischen Datensätzen. Durch die Analyse von Metaom-, Populationsgenom- und Einzelzellgenomdaten erzeugen wir experimentell überprüfbare Hypothesen, wie z.b. welche Veränderungen an Proteinen oder welche Gene assoziiert sind mit dem Auftreten einer Krankheit, von Antibiotikaresistenzen oder dem Ausweichen des Immunschutzes durch Pathogene. Wir arbeiten mit experimentellen Kollaborationspartnern zusammen, um unsere Erkenntnisse zu verifizieren und deren Translation in die medizinische Diagnostik und Behandlung zu fördern. Um die Forschungsziele zu erreichen, entwickelt die Abteilung auch neue Algorithmen und Bioinformatik-Software.
Leitung
Laufende Projekte
2021 “NFDI4Microbiota - National Research Data Infrastructure for Microbiota Research” (DFG)
2021 “GHGA-Microbiota: Increasing the multimodal use of human and microbiome-related omics data” - GHGA Flex Funds Projekt (DFG)
2021 “Hepatitis C Control: Towards prophylaxis and identification of those in need of treatment” (DZIF) (BMBF)
2019 “Paving the way towards individualized vaccination (i.Vacc) - Exploring multi-omics Big Data in the general population based on a digital mHealth cohort” – Volkswagen Stiftung
2019 “Drug discovery and cheminformatics for new anti-infectives (iCA)” – Lower Saxony Doctoral Program
2019 “Rational design of a universal flu vaccine using recombinant neuraminidase” – Global Grand Challenges of the Bill & Melinda Gates Foundation
2019 “GenomeNet: A deep neural network for genomic modelling, semi-supervised classification and imputation” – Computational Life Sciences Call, Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF)
2019 “RESIST - Resolving Infection Susceptibility“ – Exzellenzcluster 2155, Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG)
2018 “Learning structures in the CRISPR-Cas system using deep learning architectures” – SPP2141 Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG)
2017 “HiGHmed (Heidelberg-Göttingen-Hannover Medizininformatik)“ - Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF)
2014 “TI Bioressourcen, Biodaten und digitale Gesundheit” (vorher: “TI Bioinformatics Platform“ - Deutsches Zentrum für Infektionsforschung (DZIF) (BMBF)
Abgeschlossene Projekte
2020 Corona VAC “Proof of concept study of a SARS-COV-2 vaccine based on recombinant spike protein“ - Niedersächsischen Ministerium für Wissenschaft und Kultur (MWK)
2017 “Sparse2Big: Data fusion and imputation from massive sparse data consortium” - Information and Data Science Initiative, Helmholtz Society
2017 “Bioinformatics support for the development of a prophylactic HCV vaccine candidate” - Deutsches Zentrum für Infektionsforschung (DZIF)
2017 “Communities Allied in Infection coalition" - Volkswagen Foundation
2016 “A Method for Tracking CRISPR/Plasmidome Dynamics in Complex Bacterial Communities“ – Research Grant, Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG)
2014 “Isolation and characterization of novel azidophilic archaea (with J. Gescher)” – Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG)
