Master Thesis - Structure based Infection Biology
- Code:
- Masterarbeiter SBIB
- Work group:
- Nachwuchsgruppe „Strukturbasierte Infektionsbiologie“, Abteilung Strukturbiologie
- Area of research:
- Thema: Rekombinante Expression, Aufreinigung und biophysikalische Charakterisierung
- des viralen Latenz-Regulators ORF73 des Maus-Herpesvirus-68.
- Das Maus-Herpesvirus-68 (MHV-68) ist ein Modellsystem für humanpathogene Gammaherpesviren wie EBV und KSHV. Bei diesen handelt es sich um DNA-Tumorviren, die unterschiedliche Zelltypen infizieren und transformieren können.
- Unsere Arbeitsgruppe befasst sich derzeit mit strukturbiologischen Untersuchungen am Latency-Associated Nuclear Antigen (LANA, ORF73) des KSHV. Dieses Protein ist unter anderem maßgeblich an der Aufrechterhaltung der viralen Latenzphase beteiligt. Seine Interaktion mit verschiedenen Wirtsfaktoren stellt mögliche Angriffspunkte für zukünftige Therapieansätze dar. Um spezielle Erkenntnisse am Maus-Modellsystem hinsichtlich ihrer Übertragbarkeit auf das Humanpathogen bestmöglich bewerten zu können, soll nun ebenfalls das LANA-Homolog ORF73 des MHV-68 strukturbiologisch untersucht werden.
- Zu den dafür vorgesehenen Aufgaben zählen: Expression des rekombinanten Proteins in E. coli, Aufreinigung und Rückfaltung mittels Nickel-Affinitätschromatographie, Puffer-Screens u.a. mittels Thermal Shift Assay, Molekulargewichtsbestimmung nativer Komplexe mittels Feld-Fluss-Fraktionierung (AF4) und statischer Lichtstreuung, Anwendung von CD-Spektroskopie und Fourier-Transform-Infrarotspektroskopie zur Sekundärstrukturanalyse, sowie ein- und mehrdimensionaler NMR-Spektroskopie mit Isotopen-markierten Proben in Vorarbeit zur Aufklärung der 3D-Struktur. Zusätzlich sind Untersuchungen zur Bindung an zelluläre Interaktionspartner oder die spezifische DNA-Bindesequenz aus dem viralen Genom möglich.
- Prerequisite:
- Wir suchen hochmotivierte Studentinnen/Studenten, die einen Masterabschluss in Biotechnologie, Chemie oder Biologie anstreben. Bei uns erwarten dich hervorragende Arbeitsbedingungen in einem spannenden Umfeld mit modernster Ausstattung im Bereich der Protein-Biochemie, NMR-Spektroskopie und optischen Spektroskopie.
- published on:
- 14.10.2011
- Information:
Ansprechpartner: Dr. Thorsten Lührs
E-Mail: Thorsten.Luehrs@helmholtz-hzi.de
Telefonisch: 0531 - 6181 7006