Unsere Forschung
Bakterielle Infektionen höherer Säugetiere sind die Folge komplexer biologischer Prozesse in Organismen, die unterschiedlicher kaum sein könnten. Wie fördern pathogene Bakterien Infektionen und mittels welcher Mechanismen gelingt die Kolonisierung des Wirts? Welche molekularen Mechanismen bilden den Schutz eines potentiellen Wirts durch ansässige Mikroorganismen? Und welche Rolle spielen dabei nicht-kodierende RNAs? Diesen und ähnlichen Fragen gehen wir durch unsere Forschung nach. Mit Hilfe neuester RNA-Sequenzierungstechniken, die von uns auf komplexe Infektionssysteme angewandt werden, identifizieren und charakterisieren wir nicht-kodierende RNA-Moleküle in Pathogenen, sowie im Wirt und dessen kommensalen Mikroorganismen. Hierbei suchen wir nach geeigneten RNAs, die als Biomarker für die Diagnostik oder als Ziel therapeutischer Eingriffe dienen könnten.
Unsere Forschung
Bakterielle Infektionen höherer Säugetiere sind die Folge komplexer biologischer Prozesse in Organismen, die unterschiedlicher kaum sein könnten. Wie fördern pathogene Bakterien Infektionen und mittels welcher Mechanismen gelingt die Kolonisierung des Wirts? Welche molekularen Mechanismen bilden den Schutz eines potentiellen Wirts durch ansässige Mikroorganismen? Und welche Rolle spielen dabei nicht-kodierende RNAs? Diesen und ähnlichen Fragen gehen wir durch unsere Forschung nach. Mit Hilfe neuester RNA-Sequenzierungstechniken, die von uns auf komplexe Infektionssysteme angewandt werden, identifizieren und charakterisieren wir nicht-kodierende RNA-Moleküle in Pathogenen, sowie im Wirt und dessen kommensalen Mikroorganismen. Hierbei suchen wir nach geeigneten RNAs, die als Biomarker für die Diagnostik oder als Ziel therapeutischer Eingriffe dienen könnten.
Prof. Dr. Alexander Westermann
Alexander Westermann studierte Molekulare Biowissenschaft an der Universität Heidelberg und arbeitete 2009 als Gastwissenschaftler an der UC Berkeley (Kalifornien, USA). Er promovierte in der Arbeitsgruppe von Prof. Jörg Vogel am Institut für Molekulare Infektionsbiologie (IMIB) in Würzburg. 2017 und 2018 war er als Gastwissenschaftler in den Arbeitsgruppen von Prof. Andreas Bäumler (UC Davis, USA) und Prof. David Holden (Imperial College London, UK) tätig. Seit März 2018 ist er Juniorprofessor am IMIB, sowie Leiter der HOPI-Arbeitsgruppe am HIRI.
Ausgewählte Publikationen
Stapels DAC, Hill PWS, Westermann AJ, Fisher RA, Thurston TL, Saliba AE, Bloomestein I, Vogel J, Helaine S
Salmonella persisters undermine host immune defenses during antibiotic treatment
Science 2018 , 362(6419): 1156-1160
Westermann AJ, Barquist L, Vogel J
Resolving host-pathogen interactions by dual RNA-seq
PLoS Pathog 2017, 13(2): e1006033
Westermann AJ, Förstner KU, Amman F, Barquist L, Chao Y, Schulte LN, Müller L, Reinhardt R, Stadler PF, Vogel J
Dual RNA-seq unveils noncoding RNA functions in host-pathogen interactions
Nature 2016, 529(7587): 496-501
Saliba AE, Li L, Westermann AJ, Appenzeller S, Stapels DA, Schulte LN, Helaine S, Vogel J
Single-cell RNA-seq ties macrophage polarization to growth rate of intracellular Salmonella
Nature Microbiol 2016, 2:16206
Westermann AJ, Gorski SA, Vogel J
Dual RNA-seq of pathogen and host
Nat Rev Microbiol 2012, 10(9): 618-630