Neue Strategien gegen Epidemien von Infektionen zu entwickeln ist das Ziel der Abteilung „Epidemiologie“. Mit Hilfe wissenschaftlicher Studien an gesunden wie auch erkrankten Personen untersuchen Epidemiologen, wie sich Infektionskrankheiten in der Bevölkerung ausbreiten und sich diese Ausbreitung eindämmen lässt.

Leiter der Abteilung „Epidemiologie“ ist Professor Gérard Krause vom RKI (RKI) in Berlin. Dort ist er weiterhin für die Überwachung und Kontrolle von Infektionskrankheiten zuständig und hat außerdem eine Professur für Infektionsepidemiologie an der Medizinischen Hochschule Hannover (MHH) inne.