Publikationen der Arbeitsgruppe
Autoren: (Jahr: 2012). Titel: A chemical proteomics approach to identify c-di-GMP binding proteins in Pseudomonas aeruginosa. Zeitschrift: Journal of Microbiological Methods: Band: 88 Heft: 2, S-Seite: 229-E-Seite: 236
Autoren: (Jahr: 2012). Titel: A modified apriori algorithm for analysing high-dimensional gene data. Zeitschrift: LNCS: Band: 6936, S-Seite: 236-E-Seite: 243
Autoren: (Jahr: 2012). Titel: A surfactant tolerant laccase of Meripilus giganteus. Zeitschrift: World Journal of Microbiology and Biotechnology: Band: 28 Heft: 4, S-Seite: 1623-E-Seite: 1632
Autoren: (Jahr: 2012). Titel: An orphan sensor kinase controls quinolone signal production via MexT in Pseudomonas aeruginosa. Zeitschrift: Molecular Microbiology: Band: 83 Heft: 3, S-Seite: 536-E-Seite: 547
Autoren: (Jahr: 2012). Titel: Identification of persulfide-binding and disulfide-forming cysteine residues in the NifS-like domain of the molybdenum cofactor sulfurase ABA3 by cysteine-scanning mutagenesis1. Zeitschrift: Biochemistry Journal: Band: 441 Heft: 3, S-Seite: 823-E-Seite: 832
Autoren: (Jahr: 2012). Titel: Resistance phenotypes mediated by aminoacyl-phosphatidylglycerol synthases1. Zeitschrift: Journal of Bacteriology: Band: 194 Heft: 6, S-Seite: 1401-E-Seite: 1416
Autoren: (Jahr: 2012). Titel: SignalNet: Visualization of signal network responses by quantitative proteome data. Zeitschrift: Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics: Band: 6936 LNCS, S-Seite: 361-E-Seite: 368
Autoren: (Jahr: 2011). Titel: Alanyl-phosphatidylglycerol synthase: mechanism of substrate recognition during tRNA-dependent lipid modification in Pseudomonas aeruginosa. Zeitschrift: Molecular Microbiology: Band: 80 Heft: 4, S-Seite: 935-E-Seite: 950
Autoren: (Jahr: 2011). Titel: An alternative to ROC and AUC analysis of classifiers. Zeitschrift: LNCS (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics)): Band: 7014, S-Seite: 210-E-Seite: 221
Autoren: (Jahr: 2011). Titel: Biosynthesis of the repeating units of the exopolysaccarides amylovoran from Erwinia amylovora and stewartan from Pantoea stewartii. Zeitschrift: Physiological and Molecular Plant Pathology: Band: 75 Heft: 4, S-Seite: 163-E-Seite: 169 HZI-Repositorium
Autoren: (Jahr: 2011). Titel: Characterization of a hydrophobin of the ascomycete Paecilomyces farinosus. Zeitschrift: Journal of Basic Microbiology: Band: 51 Heft: 4, S-Seite: 404-E-Seite: 414
Autoren: (Jahr: 2011). Titel: Cluster validity measures based on the minimum description length principle. Zeitschrift: Lecture Notes in Computer Science: Band: 6881 LNAI (part 1), S-Seite: 82-E-Seite: 89
Autoren: (Jahr: 2011). Titel: Complete genome sequence of the animal pathogen Listeria ivanovii, which provides insights into host specificities and evolution of the genus Listeria1. Zeitschrift: Journal of Bacteriology: Band: 193 Heft: 23, S-Seite: 6787-E-Seite: 6788
Autoren: (Jahr: 2011). Titel: Diagnosis of subclinical and clinical acute T-cell-mediated rejection in renal transplant patients by urinary proteome analysis. Zeitschrift: Proteomics -Clinical Applications: Band: 5 Heft: 5-6, S-Seite: 322-E-Seite: 333
Autoren: (Jahr: 2011). Titel: Elucidation of the Dual Role of Mycobacterial MoeZR in Molybdenum Cofactor Biosynthesis and Cysteine Biosynthesis. Zeitschrift: PLoS ONE: Band: 6 Heft: 11, S-Seite: e28170
Autoren: (Jahr: 2011). Titel: Evaluation of glyceraldehyde-3-phosphate, genes as reference mRNAs in urate crystal. Zeitschrift: BMC Research Notes: Band: 4, S-Seite: 443 HZI-Repositorium
Autoren: (Jahr: 2011). Titel: Fuzzy clustering with polynomial fuzzifier function in connection with m-estimators. Zeitschrift: Applied and Computational Mathematics: Band: 10 Heft: 1, S-Seite: 146-E-Seite: 163
Autoren: (Jahr: 2011). Titel: GeneReporter--sequence-based document retrieval and annotation. Zeitschrift: Bioinformatics: Band: 27 Heft: 7, S-Seite: 1034-E-Seite: 1035
Autoren: (Jahr: 2011). Titel: Heterologous expression, refolding and characterization of a salt activated subtilase from Pleurotus ostreatus. Zeitschrift: Process Biochemistry: Band: 46 Heft: 9, S-Seite: 1840-E-Seite: 1846
Autoren: (Jahr: 2011). Titel: High-resolution mass spectrometric analysis of the secretome from mouse lung endothelial progenitor cells. Zeitschrift: Angiogenesis: Band: 14 Heft: 2, S-Seite: 163-E-Seite: 172 HZI-Repositorium PubMed
Autoren: (Jahr: 2011). Titel: Identification of nuclear magnetic resonance signals via Gaussian mixture decomposition. Zeitschrift: Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics): Band: 7014 LNCS, S-Seite: 234-E-Seite: 245
Autoren: (Jahr: 2011). Titel: Identification of peptides with deviating regulation factors using a robust clustering scheme. Zeitschrift: Advances in Intelligent and Soft Computing: Band: 93, S-Seite: 263-E-Seite: 270
Autoren: (Jahr: 2011). Titel: Plastid gene expression and plant development require a plastidic protein of the mitochondrial transcription termination factor family. Zeitschrift: Proceedings of the National Academy of Sciences USA: Band: 108 Heft: 16, S-Seite: 6674-E-Seite: 6679 HZI-Repositorium PubMed
Autoren: (Jahr: 2011). Titel: PsoP1, a Milk-Clotting Aspartic Peptidase from the Basidiomycete Fungus Piptoporus soloniensis. Zeitschrift: Journal of Agricultural and Food Chemistry: Band: 59 Heft: 18, S-Seite: 10311-E-Seite: 10316
Autoren: (Jahr: 2011). Titel: Rank correlation coefficient correction by removing worst cases.: Buchtitel: Information Processing and Management of Uncertainty in Knowledge-Based Systems: Theory and Methods. Herausgeber: Ort: Berlin : Verlag: Springer, S-Seite: 356-E-Seite: 364
Autoren: (Jahr: 2011). Titel: Saliva proteins of vector culicoides modify structure and infectivity of bluetongue virus particles. Zeitschrift: PLoS ONE: Band: 6 Heft: 3, S-Seite: e17545 HZI-Repositorium PubMed
Autoren: (Jahr: 2011). Titel: The extracellular aspartic peptidase of basidiomycete Wolfiporia cocos is a highly efficient milk clotting enzyme. Zeitschrift: Milchwissenschaft: Band: 66 Heft: 4, S-Seite: 406-E-Seite: 409
Autoren: (Jahr: 2011). Titel: The Identification of a Novel Protein Involved in Molybdenum Cofactor Biosynthesis in Escherichia coli. Zeitschrift: Journal of Biological Chemistry: Band: 286 Heft: 41, S-Seite: 35801-E-Seite: 35812
Autoren: (Jahr: 2011). Titel: The luxS mutation causes loosely-bound biofilms in Shewanella oneidensis. Zeitschrift: BMC Research Notes: Band: 4, S-Seite: 180
Autoren: (Jahr: 2010). Titel: Anaerobic adaptation in Pseudomonas aeruginosa : definition of the Anr and Dnr regulons. Zeitschrift: Environmental Microbiology: Band: 12 Heft: 6, S-Seite: 1719-E-Seite: 1733
Autoren: (Jahr: 2010). Titel: AVEDA: Statistical tests for finding interesting visulatisations. Zeitschrift: 5711 LNAI (Part 1): Band: Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics, S-Seite: 235-E-Seite: 242
Autoren: (Jahr: 2010). Titel: Columnar liquid crystals derived from crown ethers with two lateral ester-substituted ortho-terphenyl units: Unexpected destabilisation of the mesophase by potassium iodide. Zeitschrift: Liquid Crystals: Band: 37 Heft: 9, S-Seite: 1139-E-Seite: 1149
Autoren: (Jahr: 2010). Titel: Comprehensive human urine standards for comparability and standardization in clinical proteome analysis. Zeitschrift: Proteomics - Clinical Applications: Band: 4 Heft: 4, S-Seite: 464-E-Seite: 478
Autoren: (Jahr: 2010). Titel: Evaluation of Madurahydroxylactone as a Slow Release Antibacterial Implant Coating. Zeitschrift: Open Biomedical Engineering Journal: Band: 4, S-Seite: 263-E-Seite: 270
Autoren: (Jahr: 2010). Titel: Global genotype-phenotype correlations in Pseudomonas aeruginosa. Zeitschrift: PLoS Pathogens: Band: 6 Heft: 8, S-Seite: 89-E-Seite: 90 HZI-Repositorium PubMed
Autoren: (Jahr: 2010). Titel: History-dependent catastrophes regulate axonal microtubule behavior. Zeitschrift: Current biology: Band: 20 Heft: 11, S-Seite: 1023-E-Seite: 1028
Autoren: (Jahr: 2010). Titel: Incremental quantile estimation. Zeitschrift: Evolving Systems: Band: 1 Heft: 4, S-Seite: 253-E-Seite: 264
Autoren: (Jahr: 2010). Titel: Internal architecture of mitochondrial complex I from Arabidopsis thaliana. Zeitschrift: Plant Cell: Band: 22 Heft: 3, S-Seite: 797-E-Seite: 810
Autoren: (Jahr: 2010). Titel: Over-expression of PR-10a leads to increased salt and osmotic tolerance in potato cell cultures. Zeitschrift: Journal of Biotechnology: Band: 150 Heft: 3, S-Seite: 277-E-Seite: 287
Autoren: (Jahr: 2010). Titel: The first characterized asparaginase from a basidiomycete, Flammulina velutipes. Zeitschrift: Bioresource Technology: Band: 102 Heft: 3, S-Seite: 3316-E-Seite: 3321
Autoren: (Jahr: 2010). Titel: The intra- and extracellular proteome of Aspergillus niger growing on defined medium with xylose or maltose as carbon substrate. Zeitschrift: Microbial Cell Factories: Band: 9 Heft: 23, S-Seite: 1-E-Seite: 13 HZI-Repositorium PubMed
Autoren: (Jahr: 2010). Titel: The need for benchmarks with data from stochastic processes and meta-models in evolving systems.: Buchtitel: Proceedings of the International Symposium on Evolving Intelligent Systems. Herausgeber: Ort: Leicester : Verlag: SSAISB, S-Seite: 30-E-Seite: 33
Autoren: (Jahr: 2010). Titel: Urinary collagen fragments are significantly altered in diabetes: a link to pathophysiology. Zeitschrift: PLoS ONE: Band: 5 Heft: 9 HZI-Repositorium PubMed
Autoren: (Jahr: 2009). Titel: Compensation of translational displacement in time series clustering using cross correlation. Zeitschrift: Lecture Notes in Computer Science: Band: (57772 LCNS), S-Seite: 71-E-Seite: 82
Autoren: (Jahr: 2009). Titel: Genomewide identification of genetic determinants of antimicrobial drug resistance in Pseudomonas aeruginosa. Zeitschrift: Antimicrobial Agents and Chemotherapy: Band: 53 Heft: 6, S-Seite: 2522-E-Seite: 2531 HZI-Repositorium PubMed
Autoren: (Jahr: 2009). Titel: Heterologous expression of an extra-cellular lipase from the basidiomycete Pleurotus sapidus. Zeitschrift: Journal of Molecular Catalysis B: Enzymatic: Band: 57, S-Seite: 16-E-Seite: 21
Autoren: (Jahr: 2009). Titel: IRSp53 links the enterohemorrhagic E. coli effectors Tir and EspFU for actin pedestal formation. Zeitschrift: Cell Host and Microbe: Band: 5 Heft: 3, S-Seite: 244-E-Seite: 258
Autoren: (Jahr: 2009). Titel: MS-specific noise model reveals the potential of iTRAQ in quantitative proteomics. Zeitschrift: Bioinformatics: Band: 25 Heft: 8, S-Seite: 1004-E-Seite: 1011 HZI-Repositorium PubMed
Autoren: (Jahr: 2009). Titel: Quantitative phosphokinome analysis of the met pathway activated by the invasin internalin B from Listeria monocytogenes. Zeitschrift: Molecular and Cellular Proteomics: Band: 8 Heft: 12, S-Seite: 2778-E-Seite: 2795
Autoren: (Jahr: 2008). Titel: A structural investigation of complex I and I+III(2) supercomplex from Zea mays at 11-13 A resolution: Assignment of the carbonic anhydrase domain and evidence for structural heterogeneity within complex I. Zeitschrift: Biochimica et biophysica acta: Band: 1777 Heft: 1, S-Seite: 84-E-Seite: 93 HZI-Repositorium PubMed
Autoren: (Jahr: 2008). Titel: Clustering likelihood curves: Finding deviations from single clusters.: Buchtitel: Hybrid Artificial Intelligence Systems. Herausgeber: Ort: Berlin Heidelberg : Verlag: Springer Verlag, S-Seite: 385-E-Seite: 391
Autoren: (Jahr: 2008). Titel: Lipoproteins of Listeria monocytogenes are critical for virulence and TLR2-mediated immune activation. Zeitschrift: Journal of Immunology: Band: 181 Heft: 3, S-Seite: 2028-E-Seite: 2035
Autoren: (Jahr: 2008). Titel: Nitrate-responsive NarX-NarL represses arginine-mediated induction of the Pseudomonas aeruginosa arginine fermentation arcDABC operon1. Zeitschrift: Microbiology: Band: 154 Heft: Pt 10, S-Seite: 3053-E-Seite: 3060
Autoren: (Jahr: 2008). Titel: ProdoNet: identification and visualization of prokaryotic gene regulatory and metabolic networks. Zeitschrift: Nucleic Acids Research: Band: 36 Heft: Web Server issue, S-Seite: W460-E-Seite: W464
Autoren: (Jahr: 2008). Titel: Quantitative gel electrophoresis: sources of variation. Zeitschrift: Journal of Proteome Research: Band: 7 Heft: 3, S-Seite: 1226-E-Seite: 1234
Autoren: (Jahr: 2008). Titel: Structure of xylogalacturonan fragments from watermelon cell-wall pectin. Endopolygalacturonase can accommodate a xylosyl residue on the galacturonic acid just following the hydrolysis site. Zeitschrift: Carbohydrate Research: Band: 343 Heft: 7, S-Seite: 1212-E-Seite: 1221
Autoren: (Jahr: 2007). Titel: A sucrose-inducible promoter system for the intra- and extracellular protein production in Bacillus megaterium. Zeitschrift: Journal of Biotechnology: Band: 132 Heft: 4, S-Seite: 426-E-Seite: 430 Volltext HZI-Repositorium
Autoren: (Jahr: 2007). Titel: Inactivation of Lgt allows systematic characterization of lipoproteins from Listeria monocytogenes. Zeitschrift: Journal of Bacteriology: Band: 189 Heft: 2, S-Seite: 313-E-Seite: 324 HZI-Repositorium PubMed
Autoren: (Jahr: 2007). Titel: Pathogenomics of Listeria spp.. Zeitschrift: International Journal of Medical Microbiology: Band: 297 Heft: 7-8, S-Seite: 541-E-Seite: 557
Autoren: (Jahr: 2007). Titel: Proteomic analysis of the U1 snRNP of Schizosaccharomyces pombe reveals three essential organism-specific proteins. Zeitschrift: Nucleic Acids Research: Band: 35 Heft: 5, S-Seite: 1391-E-Seite: 1401
Autoren: (Jahr: 2007). Titel: Proteomics analysis of protein kinases by target class-selective pre-fractionation and tandem mass spectrometry. Zeitschrift: Molecular & Cellular Proteomics: Band: 6 Heft: 3, S-Seite: 537-E-Seite: 547 HZI-Repositorium PubMed
Autoren: (Jahr: 2006). Titel: Anaerobic survival of Pseudomonas aeruginosa by pyruvate fermentation requires an Usp-type stress protein. Zeitschrift: Journal of Bacteriology: Band: 188, S-Seite: 659-E-Seite: 668 HZI-Repositorium PubMed
Autoren: (Jahr: 2006). Titel: Carbonic anhydrase subunits form a matrix-exposed domain attached to the membrane arm of mitochondrial complex I in plants. Zeitschrift: Journal of Biological Chemistry: Band: 281 Heft: 10, S-Seite: 6482-E-Seite: 6488 HZI-Repositorium PubMed
Autoren: (Jahr: 2006). Titel: Characterization of the Drosophila Lipid Droplet Subproteome. Zeitschrift: Molecular & Cellular Proteomics: Band: 5, S-Seite: 1082-E-Seite: 1094 HZI-Repositorium PubMed
Autoren: (Jahr: 2006). Titel: Direct mass spectrometric peptide profiling and fragmentation of larval peptide hormone release sites in Drosophila melanogaster reveals tagma-specific peptide expression and differential processing. Zeitschrift: Journal of Neurochemistry: Band: 96 Heft: 5, S-Seite: 1362-E-Seite: 1374
Autoren: (Jahr: 2006). Titel: Elucidation of mechanisms of acid stress in Listeria monocytogenes by proteomic analysis.: Buchtitel: Microbial Proteomics - Functional Biology of Whole Organisms. Herausgeber: Ort: Hoboken, New Jersey : Verlag: John Wiley & Sons, S-Seite: 75-E-Seite: 88
Autoren: (Jahr: 2006). Titel: LEGER: knowledge database and visualization tool for comparative genomics of pathogenic and non-pathogenic Listeria species. Zeitschrift: Nucleic Acids Research: Band: 34, S-Seite: D402-E-Seite: D406
Autoren: (Jahr: 2006). Titel: Quantitative analysis of receptor tyrosine kinase signaling exploited by Listeria monocytogenes. Zeitschrift: Molecular & Cellular Proteomics: Band: 5 Heft: 10, S-Seite: S168-E-Seite: S168 654 Suppl.
Autoren: (Jahr: 2006). Titel: Quorum-sensing antagonistic activities of azithromycin in Pseudomonas aeruginosa PAO1: a global approach. Zeitschrift: Antimicrobial Agents and Chemotherapy: Band: 50, S-Seite: 1680-E-Seite: 1688 HZI-Repositorium PubMed
Autoren: (Jahr: 2006). Titel: The cell wall subproteome of Listeria monocytogenes.: Buchtitel: Proteomics of Microbial Pathogens. Herausgeber: Ort: Weinheim : Verlag: Wiley-VCH, S-Seite: 153-E-Seite: 177
Autoren: (Jahr: 2006). Titel: The MprF protein is required for lysinylation of phospholipids in listerial membranes and confers resistance to cationic antimicrobial peptides (CAMPs) on Lysteria monocytogenes. Zeitschrift: Molecular Microbiology: Band: 62, S-Seite: 1325-E-Seite: 1339 HZI-Repositorium PubMed
Autoren: (Jahr: 2006). Titel: The Pseudomonas aeruginosa universal stress protein PA4352 is essential for surviving anaerobic energy stress. Zeitschrift: Journal of Bacteriology: Band: 188 Heft: 18, S-Seite: 6529-E-Seite: 6538
Autoren: (Jahr: 2006). Titel: The substrate radical of Escherichia coli oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase HemN. Zeitschrift: Journal of Biological Chemistry: Band: 281, S-Seite: 15727-E-Seite: 15734
Autoren: (Jahr: 2006). Titel: VIS-O-BAC: exploratory visualization of functional genome studies from bacteria. Zeitschrift: Bioinformatics: Band: 22 Heft: 5, S-Seite: 630-E-Seite: 631
Autoren: (Jahr: 2005). Titel: Comparative proteome analysis of secretory proteins from pathogenic and non-pathogenic Listeria species. Zeitschrift: Proteomics: Band: 5, S-Seite: 1544-E-Seite: 1557
Autoren: (Jahr: 2005). Titel: Enzymes involved in anaerobic respiration appear to play a role in Actinobacillus pleuropneumoniae virulence. Zeitschrift: Infection and Immunity: Band: 73 Heft: 1, S-Seite: 226-E-Seite: 234 HZI-Repositorium PubMed
Autoren: (Jahr: 2005). Titel: MineBlast: A literature presentation service supporting protein annotation by data Mining of blast results. Zeitschrift: Bioinformatics: Band: 21, S-Seite: 3450-E-Seite: 3451
Autoren: (Jahr: 2005). Titel: Proteomic characterization of the angiogenesis inhibitor SU6668 reveals multiple impacts on cellular kinase signaling. Zeitschrift: Cancer Research: Band: 65 Heft: 15, S-Seite: 6919-E-Seite: 6926
Autoren: (Jahr: 2004). Titel: Mitochondrial cytochrome c oxidase and succinate dehydrogenase complexes contain plant specific subunits. Zeitschrift: Plant Molecular Biology: Band: 56 Heft: 1, S-Seite: 77-E-Seite: 90
Autoren: (Jahr: 2004). Titel: Systematic identification of covalently-bound cell wall proteins and analysis of protein-polysaccharide linkages of the human pathogen Candida glabrata. Zeitschrift: Microbiology: Band: 150, S-Seite: 3129-E-Seite: 3144

